一般情況下，一般納稅人的代理記賬收費會比小規模納稅人公司的代理記賬費用要高很多。因為，如果公司是一般納稅人，那么他能自己開發票，他的業務量會比小規模納稅人的公司多，每月的原始憑證也會更多。

二、該公司的企業規模

企業的規模大小，對費用是有著很大影響的。比如，中等規模的企業，每月財務工作多且難度大，費用自然更高。

三、該公司的營業收入

公司的營業收入越高，公司的往來業務也就越多，代理記賬公司為該客戶公司承擔的財務風險也越大，這樣代理費用就越高。所以，公司日常財務來往所獲得的收入情況，也是重要的考量。

四、公司類型

不同的公司類型在財務工作量也會有所差異，比如，貿易類公司的發票往往比其他類型的公司要多；再比如，生產類公司的生產流程比較復雜，原始憑證種類也比較多，所以對于不同行業的公司，代理記賬公司的收費會不一樣。